RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CA6	P23280	308 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CHAT	P28329	748 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	DCTD	P32321	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF92	Q03936	586 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OPCML	Q14982	345 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MPPED2	Q15777	294 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	AVPI1	Q5T686	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FAM166A	Q6J272	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OCC1	Q8TAD7	63 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FAM46B	Q96A09	425 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM106A	Q96A25	262 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SGK3	Q96BR1	496 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR8B4	Q96RC9	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MICU1	Q9BPX6	476 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ARL6	Q9H0F7	186 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GLS2	Q9UI32	602 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	HHLA2	Q9UM44	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MED13L	Q71F56	2210 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PLCE1	Q9P212	2302 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0D9SG52	128 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		H0YL77	283 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SLC17A2	O00624	439 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	UBB	P0CG47	229 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CXCL3	P19876	107 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	HTR2C	P28335	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CD34	P28906	385 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	S100A11	P31949	105 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	BTC	P35070	178 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CD200	P41217	278 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	POU3F4	P49335	361 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CLDN12	P56749	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TAS2R31	P59538	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FAM3A	P98173	230 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	BAMBI	Q13145	260 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB2A2	Q13296	93 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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