RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	AMY1A	P04745	511 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	AMY2A	P04746	511 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	CD37	P11049	281 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	HTD2	P86397	168 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MXD1	Q05195	221 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SSR4-208	ENST00000471880	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	YPEL1	O60688	119 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NAPSA	O96009	420 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MOS	P00540	346 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PF4V1	P10720	104 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GNB3	P16520	340 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GAL	P22466	123 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CD1B	P29016	333 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TALDO1	P37837	337 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM6	P40199	344 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR3A3	P47888	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM50B	P56557	158 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	DEFA6	Q01524	100 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FGF16	O43320	207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KCNAB3	O43448	404 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	WIPF1	O43516	503 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LANCL1	O43813	399 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OPN1MW	P04001	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SCT	P09683	121 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CD36	P16671	472 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB25	P24278	435 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LSAMP	Q13449	338 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MMD	Q15546	238 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZPA2	131 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	S1PR3	Q99500	378 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		Q9N2K0	584 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	BET1	O15155	118 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PF4	P02776	101 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RAB6A	P20340	208 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF137P	P52743	207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35B1	P78383	322 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53

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