RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBLN7Q53RD9 439 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 IDNKQ5T6J7 187 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR107Q5VW38 600 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf88Q6PI97 169 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZSV7 163 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR141Q7Z602 305 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRR18Q8N4B5 295 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q8N6K4 173 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 AGMATQ9BSE5 352 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM235A6NFC5 223 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 FABP7O15540 132 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 SSX5O60225 188 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV3-7P01780 117 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 CRYBA1P05813 215 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZBTB25P24278 435 aa6.64□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TMBIM6P55061 237 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 PROK1P58294 105 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 EBI3Q14213 229 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLA1AQ53H76 456 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR56B4Q8NH76 319 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01006Q8NI28 216 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 CMTM3Q96MX0 182 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF747Q9BV97 191 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 GHITMQ9H3K2 345 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF702PQ9H963 129 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 BEX1Q9HBH7 125 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1W2PPE3 182 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0QZK8 103 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SCTP09683 121 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 CD1BP29016 333 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 LSAMPQ13449 338 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 LY6EQ16553 131 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDNFQ49AH0 187 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM219Q86XT9 240 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 DRAM1Q8N682 238 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 DTX3Q8N9I9 347 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 AP3S1Q92572 193 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A075B6Q4 140 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB29O14966 203 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 FGF16O43320 207 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 AMY1AP04745 511 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 AMY2AP04746 511 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC3-206ENST00000469757 REG1BP48304 166 aa6.62□□□□□ -1.35
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