RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	FXYD1	O00168	92 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ENTPD6	O75354	484 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SERPINA3	P01011	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	FUT6	P51993	359 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CX3CL1	P78423	397 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SCN1B	Q07699	218 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	PLGLA	Q15195	96 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	UTF1	Q5T230	341 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RRH	O14718	337 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	DEGS1	O15121	323 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	IFNG	P01579	166 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	AMBP	P02760	352 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CGB3	P0DN86	165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CGB7	P0DN87	165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	FOLR2	P14207	255 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SPI1	P17947	270 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GZMH	P20718	246 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SMIM11A	P58511	58 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274		Q3ZCU0	254 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	POC5	Q8NA72	575 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	NPB	Q8NG41	125 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	COQ2	Q96H96	371 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	TEAD3	Q99594	435 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ZNF682	O95780	498 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GYPB	P06028	91 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	BCL3	P20749	454 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	NUDT2	P50583	147 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ATP1B3	P54709	279 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	NDP	Q00604	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274		Q6ZTC4	211 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NCL-208	ENST00000466274	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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