RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 MAP2K4P45985 399 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MFAP2P55001 183 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 Q6ZR03 302 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM17Q86X19 198 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RDH10Q8IZV5 341 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR5AS1Q8N127 324 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 FTMTQ8N4E7 242 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 OR51A4Q8NGJ6 313 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 ROS1P08922 2347 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 CST4P01036 141 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHV1-46P01743 117 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CD55P08174 381 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CELP19835 753 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 HILS1P60008 231 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 KRTAP10-11P60412 298 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TPBGQ13641 420 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 GHSRQ92847 366 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 UFD1Q92890 307 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 C10orf35Q96D05 121 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OPALINQ96PE5 141 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MGLLQ99685 303 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC22A4Q9H015 551 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRPF4B-204ENST00000466185 TPK1Q9H3S4 243 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM100Q9NV29 134 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ENPP5Q9UJA9 477 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PIGLQ9Y2B2 252 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PDZD2O15018 2839 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 POLQO75417 2590 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RTTNQ86VV8 2226 aa4.69□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 H3BSH0 61 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 HLA-DPB1P04440 258 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OCM2P0CE71 109 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 HSMCR30P0CW71 290 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PSMB9P28065 219 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CD200P41217 278 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 EFNA4P52798 201 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PRDX4Q13162 271 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MAB21L1Q13394 359 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR8G1Q15617 311 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 SSX1Q16384 188 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 Q499Y3 187 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 UTS2BQ765I0 119 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PHC2Q8IXK0 858 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 MS4A15Q8N5U1 240 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 SPERTQ8NA61 448 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR2Z1Q8NG97 314 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PP6455Q8WZ26 134 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 PIGCQ92535 297 aa4.68□□□□□ -1.66
PRPF4B-204ENST00000466185 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
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