RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 RDH5Q92781 318 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NINJ1Q92982 152 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GALMQ96C23 342 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GPR146Q96CH1 333 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HES7Q9BYE0 225 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PRSS50Q9UI38 385 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GWJ7 208 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NKX2-8O15522 239 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 F10P00742 488 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ADH4P08319 380 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AGAP20933 346 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CEACAM6P40199 344 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PAX9P55771 341 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GUSBP1Q15486 140 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AWAT1Q58HT5 328 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TVP23CQ96ET8 276 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C12orf49Q9H741 205 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PSENENQ9NZ42 101 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RTTNQ86VV8 2226 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C9JQL5 133 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RAB29O14966 203 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HAND1O96004 215 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IGKV3-15P01624 115 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GLI4P10075 376 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PSG2P11465 335 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RAB5AP20339 215 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 COX5AP20674 150 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GZMHP20718 246 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1-2P23083 117 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 GCH1P30793 250 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IL2RGP31785 369 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CFHR2P36980 270 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HTD2P86397 168 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TESK1Q15569 626 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OR51H1Q8NH63 302 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C14orf79Q96F83 325 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CYYR1Q96J86 154 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TAAR6Q96RI8 345 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SPTBN2O15020 2390 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PCSK5Q92824 1860 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ITGB1BP1O14713 200 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SPINT2O43291 252 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CST7O76096 145 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF205O95201 554 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OMGP23515 440 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NFYBP25208 207 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PSG7Q13046 419 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF154Q13106 437 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 BEND4Q6ZU67 534 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SSX8Q7RTT4 187 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 FGFRL1Q8N441 504 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.18□□□□□ -1.26
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