RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-215	ENST00000442447	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PDCD5	O14737	125 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LDLRAD4	O15165	306 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LANCL1	O43813	399 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	YPEL1	O60688	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PSMB9	P28065	219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	CD1B	P29016	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TMEM50B	P56557	158 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	YPEL2	Q96QA6	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RGS11	O94810	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	MOS	P00540	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RANBP1	P43487	201 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	C22orf42	Q6IC83	251 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR4F4	Q96R69	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PECR	Q9BY49	303 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	HSF4	Q9ULV5	492 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	NOTCH1	P46531	2555 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	IFITM5	A6NNB3	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	GAL	P22466	123 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LSAMP	Q13449	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF329	Q86UD4	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447		Q8N9W7	124 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	FCGR1B	Q92637	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RAB22A	Q9UL26	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447		A0A0B4J203	849 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SMIM30	A4D0T7	59 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447		G3V4G9	280 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ST8SIA5	O15466	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	IGHG2	P01859	326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RAB3B	P20337	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR3A3	P47888	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	HLA-DRB3	P79483	266 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF773	Q6PK81	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	S1PR3	Q99500	378 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	PF4V1	P10720	104 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	GPR12	P47775	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	F2RL1	P55085	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	NABP2	Q9BQ15	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	ABCG5	Q9H222	651 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447		Q9N2K0	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	SCT	P09683	121 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	STPG2	Q8N412	459 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RAB3C	Q96E17	227 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	STUB1	Q9UNE7	303 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM39-215	ENST00000442447	HSPA12A	O43301	675 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	RAB6A	P20340	208 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	CEACAM6	P40199	344 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	MMD	Q15546	238 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RBM39-215	ENST00000442447	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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