RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439479.1

AC106706.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC106706.1, Length 556 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC106706.1-201ENST00000439479 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 HOGA1Q86XE5 327 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 BEST4Q8NFU0 473 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 MALSU1Q96EH3 234 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 ABHD1Q96SE0 405 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 MMP28Q9H239 520 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 DPM3Q9P2X0 92 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.65□□□□□ -1.02
AC106706.1-201ENST00000439479 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LEUTXA8MZ59 168 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 BET1O15155 118 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ARPC4P59998 168 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 GNMTQ14749 295 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 IGSF11Q5DX21 431 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LINC00311Q8N616 119 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 GPX8Q8TED1 209 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.64□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 A0A1W2PPE3 182 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 TMEM89A2RUT3 159 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CLDN34H7C241 214 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RBBP9O75884 186 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 FCER2P06734 321 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 NAT1P18440 290 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 IL3RAP26951 378 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RAB7AP51149 207 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ZNF134P52741 427 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 HERPUD1Q15011 391 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SSX2Q16385 188 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 Q6YL49 198 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 C17orf50Q8WW18 174 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 AJUBAQ96IF1 538 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SOSTQ9BQB4 213 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 GINS4Q9BRT9 223 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 GHITMQ9H3K2 345 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.63□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OOSP1A8MZH6 123 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LY6LH3BQJ8 138 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 GABARAPH6UMI1 98 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ITGB1BP1O14713 200 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CTDSPLO15194 276 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RCVRNP35243 200 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR3A3P47888 321 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ARHGDIBP52566 201 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ACTBP60709 375 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 CCDC190Q86UF4 302 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 LYG1Q8N1E2 194 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 OR52I2Q8NH67 350 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RPEQ96AT9 228 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 RDH8Q9NYR8 311 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 KLK11Q9UBX7 282 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.62□□□□□ -1.03
AC106706.1-201ENST00000439479 SLC31A2O15432 143 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms