RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.71□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 V9GY05 133 aa9.71□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.69□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 ARL11Q969Q4 196 aa9.69□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.69□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 OR10A3P58181 314 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 KIR2DS1Q14954 304 aa9.68□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 HMGN3Q15651 99 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 RAB11BQ15907 218 aa9.68□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 C22orf42Q6IC83 251 aa9.68□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 OR4K15Q8NH41 348 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 CCDC107Q8WV48 283 aa9.68□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 RAB9BQ9NP90 201 aa9.68□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PPE3 182 aa9.67□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 LINC01548A6NM66 108 aa9.67□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 HBZP02008 142 aa9.67□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 HTD2P86397 168 aa9.67□□□□□ -0.86
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PRAME-204ENST00000403441 EBI3Q14213 229 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 STEAP3Q658P3 488 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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