RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 MADCAM1Q13477 382 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 EBI3Q14213 229 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 HNF4GQ14541 408 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 Q3ZCU0 254 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CDNFQ49AH0 187 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IGSF11Q5DX21 431 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IDNKQ5T6J7 187 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 Q6ZS49 121 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 THNSL2Q86YJ6 484 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR8H3Q8N146 312 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 LYG1Q8N1E2 194 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 Q8N6K4 173 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 C3orf56Q8N813 242 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR10X1Q8NGY0 326 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR4F5Q8NH21 305 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SETD6Q8TBK2 473 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CAPSLQ8WWF8 208 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TOMM40LQ969M1 308 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RPEQ96AT9 228 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RAB3CQ96E17 227 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CITED1Q99966 193 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 NABP2Q9BQ15 211 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 AGMATQ9BSE5 352 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A33Q9BSK2 321 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CABLES2Q9BTV7 478 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 WNT10AQ9GZT5 417 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TOLLIPQ9H0E2 274 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ATG5Q9H1Y0 275 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IFI27L2Q9H2X8 130 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 BEX1Q9HBH7 125 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RHBDL2Q9NX52 303 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 GNG12Q9UBI6 72 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 JPT1Q9UK76 154 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA2Q9UM82 520 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TRAV18A0A075B6X5 111 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 BTBD17A6NE02 478 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINE3A8MV23 424 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 H3BUI4 141 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ITGB1BP1O14713 200 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 FABP7O15540 132 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 LANCL1O43813 399 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 OR2F2O95006 317 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1D-33P01593 117 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1-33P01594 117 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 IGLV2-14P01704 120 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 HLA-DQB1P01920 261 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CRYBA1P05813 215 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 FCER2P06734 321 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 LPLP06858 475 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CT45A6P0DMU7 189 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CT45A5P0DMU8 189 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CT45A7P0DMV0 189 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CD28P10747 220 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM11P17152 192 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CNTFRP26992 372 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM3P40198 252 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SCAND1P57086 179 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 LSAMPQ13449 338 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SPCS2Q15005 226 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 RPL39P5Q59GN2 51 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 GPR107Q5VW38 600 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 HACD4Q5VWC8 232 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 STEAP3Q658P3 488 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 C11orf88Q6PI97 169 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 SHISA2Q6UWI4 295 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 LIAT1Q6ZQX7 453 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD17-201ENST00000390930 MOB1BQ7L9L4 216 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms