RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NELFBQ8WX92 580 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRSS27Q9BQR3 290 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BEX2Q9BXY8 128 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GOLGA8TH3BQL2 631 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 I3L4J1 428 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGHV1-69P01742 117 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UCHL1P09936 223 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD24P25063 80 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TSPOP30536 169 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PROKR2Q8NFJ6 384 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DOK4Q8TEW6 326 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACBD6Q9BR61 282 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FBXL15Q9H469 300 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TENM4Q6N022 2769 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MUC2Q02817 5179 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H3BSA7 217 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZMPSTE24O75844 475 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SERPINA7P05543 415 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPNP16150 400 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NPPCP23582 126 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAB38P57729 211 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ELOBQ15370 118 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR2AG1Q9H205 316 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HAUS4Q9H6D7 363 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HPCAL4Q9UM19 191 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GLI3P10071 1580 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 WDR90Q96KV7 1748 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TVP23AA6NH52 213 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR11H12B2RN74 326 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CRYBB3P26998 211 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 REG1BP48304 166 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AQP4P55087 323 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSMC5P62195 406 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM3AP98173 230 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BAXQ07812 192 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GUSBP1Q15486 140 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KATNAL2Q8IYT4 538 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 YIPF7Q8N8F6 280 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR11H2Q8NH07 326 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CERS2Q96G23 380 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ABCB11O95342 1321 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HMSDA8MTL9 139 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C8orf87E5RJ46 101 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 K7EN84 100 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSMD11O00231 422 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BHLHE40O14503 412 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD164Q04900 197 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RESP18Q5W5W9 173 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DRAM2Q6UX65 266 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR51T1Q8NGJ9 327 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GPX8Q8TED1 209 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC7A6Q92536 515 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NAV1Q8NEY1 1877 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DSCAMO60469 2012 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 WRBO00258 174 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EPPINO95925 133 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP6V0CP27449 155 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCR2P41597 374 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FGF12P61328 243 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPAG1Q07617 926 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAB11BQ15907 218 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C10orf55Q5SWW7 151 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM162BQ5T6X4 162 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM173BQ6P4H8 233 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DCXRQ7Z4W1 244 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C9orf163Q8N9P6 203 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR11L1Q8NGX0 322 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DTD1Q8TEA8 209 aa-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms