RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 GABRR1P24046 479 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PAX6P26367 422 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HTR1DP28221 377 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ATP6V1E1P36543 226 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CEACAM3P40198 252 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RBP2P50120 134 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RAB13P51153 203 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ATP1B3P54709 279 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DLX6P56179 175 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CXCR4P61073 352 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ACTA2P62736 377 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ACTG2P63267 376 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ACTC1P68032 377 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ACTA1P68133 377 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF273Q14593 569 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GRK1Q15835 563 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR8H2Q8N162 312 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 Q8NBF4 154 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PIFOQ8TCI5 191 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PP6455Q8WZ26 134 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 STMN2Q93045 179 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 C10orf35Q96D05 121 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BORCS8Q96FH0 119 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 OR5M11Q96RB7 305 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 APOL4Q9BPW4 351 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 HES4Q9HCC6 221 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 KRT84Q9NSB2 600 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DPM3Q9P2X0 92 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 V9GYS6 101 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1B0GTI1 187 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC182A6NF36 153 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 A6NIN4 97 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 METTL15A6NJ78 407 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 C15orf61A6NNL5 157 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 LEUTXA8MZ59 168 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 G3V2T6 193 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TOR1AO14656 332 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SH2D1BO14796 132 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 GYG2O15488 501 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 FKBP6O75344 327 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SULT1C4O75897 302 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-204ENST00000367379 CCL1P22362 96 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRKACBP22694 351 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MNDAP41218 407 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 DAPP51397 102 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 PRRX1P54821 245 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MTCP1P56278 107 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 CDC42P60953 191 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BLCAPP62952 87 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SLC35A2P78381 396 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 BDH1Q02338 343 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TMED1Q13445 227 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 EDDM3AQ14507 147 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 ODF4Q2M2E3 257 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-204ENST00000367379 FAHD1Q6P587 224 aa3.56□□□□□ -1.84
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