RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 S100A2P29034 98 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ERVK11-1P61568 191 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 WDR86Q86TI4 376 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 VSIRQ9H7M9 311 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.43■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 IFITM10A6NMD0 228 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 WDR1O75083 606 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 IFNA1P01562 189 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF883P0CG24 379 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 RND2P52198 227 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 VAX2Q9UIW0 290 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.42■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TGOLN2O43493 480 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BKO60814 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BJP06899 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BOP23527 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BBP33778 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MEOX1P50221 254 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BDP58876 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BCP62807 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 DRAM1Q8N682 238 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN34H7C241 214 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF146Q15072 292 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SSX7Q7RTT5 188 aa15.41■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MED12LQ86YW9 2145 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SP1P08047 785 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PGA5P0DJD9 388 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 FAM210BQ96KR6 192 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SH2D1BO14796 132 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NXPH2O95156 264 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CEACAM6P40199 344 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PMS2P11Q13670 270 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 IGFBP7Q16270 282 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 OR4C12Q96R67 309 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.4■□□□□ 0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 SMPD2O60906 423 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 TRGC2P03986 189 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 LPAL2Q16609 132 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 FAM209BQ5JX69 171 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC13O75165 2243 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1CBP62140 327 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF9Q07011 255 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 FGFRL1Q8N441 504 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 MDS2Q8NDY4 140 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 UBALD1Q8TB05 177 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R2P9O14990 202 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 SLC10A1Q14973 349 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 GABRA6Q16445 453 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-201ENST00000355530 OPN1MWP04001 364 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114 ms