RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302273.2

VPREB1-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene VPREB1, Length 626 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-201ENST00000302273 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HOGA1Q86XE5 327 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CCDC107Q8WV48 283 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DPM3Q9P2X0 92 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GNG12Q9UBI6 72 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GAB2Q9UQC2 676 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ALG5Q9Y673 324 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 JMJD1CQ15652 2540 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 CENPXA8MT69 81 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 INAFM1C9JVW0 142 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 GABARAPH6UMI1 98 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 CLDN34H7C241 214 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 J3QR06 171 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TXNL1O43396 289 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RBBP9O75884 186 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SLC22A5O76082 557 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 FBP1P09467 338 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 IL3RAP26951 378 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SSTR5P35346 364 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 DYNLT3P51808 116 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF137PP52743 207 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TAS2R46P59540 309 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 HLA-DRB3P79483 266 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 DYRK1AQ13627 763 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TATDN3Q17R31 274 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 HCP5Q6MZN7 132 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TMEM86BQ8N661 226 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 GPX8Q8TED1 209 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 LHX4Q969G2 390 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ING3Q9NXR8 418 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.21□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 CR1P17927 2039 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 HSPA12AO43301 675 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SSX5O60225 188 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 GDNFP39905 211 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ACTBL2Q562R1 376 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 PNKDQ8N490 385 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 BEST4Q8NFU0 473 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RFESDQ8TAC1 157 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 IFT46Q9NQC8 304 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 COPZ2Q9P299 210 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 PSG11Q9UQ72 335 aa7.2□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 C7orf66A4D0T2 115 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 LY6LH3BQJ8 138 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RAB29O14966 203 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 MMP23AO75900 390 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 DHFRP00374 187 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 TCRBP04435 133 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 ARG1P05089 322 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SCTP09683 121 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 GSTT2BP0CG30 244 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 OMGP23515 440 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 NFYBP25208 207 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 BRS3P32247 399 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 RCVRNP35243 200 aa7.19□□□□□ -1.26
VPREB1-201ENST00000302273 SAA4P35542 130 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms