RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TATDN3Q17R31 274 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LPCAT4Q643R3 524 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STEAP3Q658P3 488 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STX19Q8N4C7 294 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPBQ8NG41 125 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.7□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NDUFA3O95167 84 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYNJ2BPP57105 145 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CX3CL1P78423 397 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRG5Q8IZF4 528 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM106AQ96A25 262 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NEURL2Q9BR09 285 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM107BQ9H098 131 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.69□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TFAP2AP05549 437 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EFNB1P98172 346 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASB9Q96DX5 294 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXL15Q9H469 300 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFT22Q9H7X7 185 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0G2JLM5 398 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GABRPO00591 440 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DEDDO75618 318 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MT-ND4P03905 459 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DAPP51397 102 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCR9P51686 369 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF85Q03923 595 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C6orf183Q5T699 404 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DEFB125Q8N687 156 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LFNGQ8NES3 379 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RDH12Q96NR8 316 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 B2RBV5 119 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RRHO14718 337 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HBZP02008 142 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAB3AP20336 220 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C12orf73Q69YU5 71 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FDX2Q6P4F2 183 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LINC00596Q86U02 117 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR52N1Q8NH53 320 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 S100A13Q99584 98 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZAR1LA6NP61 321 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR11H12B2RN74 326 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FCN1O00602 326 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDRT1O95170 752 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSN3P07498 182 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MORN2Q502X0 79 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAX1Q8IWV1 398 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR1L1Q8NH94 360 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RFKQ969G6 155 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRBF2Q96F24 287 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CLCC1Q96S66 551 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 METTL9Q9H1A3 318 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PEMTQ9UBM1 199 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ING4Q9UNL4 249 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNCP24821 2201 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DAPL1A0PJW8 107 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AQP12BA6NM10 295 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SNX3O60493 162 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD7P09564 240 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SERPINA2P20848 420 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EPHA2P29317 976 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms