RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 DEFB123Q8N688 67 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 HIPK2Q9H2X6 1198 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 UBE2CO00762 179 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 SMPD2O60906 423 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 DFFBO76075 338 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 IGKV1-5P01602 117 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 ERVS71-1P61550 626 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 YPEL4Q96NS1 127 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 OR2J1Q9GZK6 312 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 WSB1Q9Y6I7 421 aa17.02■□□□□ 0.32
TIMM44-210ENST00000599939 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CD46P15529 392 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 DHRS13Q6UX07 377 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 THNSL2Q86YJ6 484 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 H3BQ15 152 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 TNFSF15O95150 251 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 S100A6P06703 90 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 FBP1P09467 338 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SP9P0CG40 484 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CBR1P16152 277 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF585BQ52M93 769 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF506Q5JVG8 444 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 DPPA3Q6W0C5 159 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 MALSU1Q96EH3 234 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa17.01■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 PPP1CBP62140 327 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 TLE4Q04727 773 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ADAM5Q6NVV9 412 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 Q8IYB0 196 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 H0YL77 283 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 J3QW42 95 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CDIPTO14735 213 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SYNGR2O43760 224 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 OR2C1O95371 312 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 PGA5P0DJD9 388 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 MAS1LP35410 378 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CEBPGP53567 150 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 PLA2G2CQ5R387 149 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 RAB39BQ96DA2 213 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 KCNS2Q9ULS6 477 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa17■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 LOC400499M0QZD8 3231 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 USF3Q68DE3 2245 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IFNA5P01569 189 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IAPPP10997 89 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 OR2B8PP59922 312 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 RSG1Q9BU20 258 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.99■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ARL16Q0P5N6 197 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF146Q15072 292 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 WDR1O75083 606 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 NXPH2O95156 264 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IGHV2-5P01817 119 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 HBE1P02100 147 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SELEP16581 610 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF766Q5HY98 468 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 HES3Q5TGS1 186 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SLC25A24Q6NUK1 477 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 MUCL1Q96DR8 90 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.98■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 METTL15P1P0C7V9 234 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 DRAM1Q8N682 238 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CACNA1DQ01668 2161 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 IGHV1-2P23083 117 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 CEACAM6P40199 344 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ARG2P78540 354 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF429Q86V71 674 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF525Q8N782 197 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.97■□□□□ 0.31
TIMM44-210ENST00000599939 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms