RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB12Q6IQ22 244 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LYPD6Q86Y78 171 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRR18Q8N4B5 295 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KCTD7Q96MP8 289 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RDH12Q96NR8 316 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BANF2Q9H503 90 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IRGMA1A4Y4 181 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LANCL1O43813 399 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DOC2BQ14184 412 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GNMTQ14749 295 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MORN2Q502X0 79 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 STEAP3Q658P3 488 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM80Q96HE8 168 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RITA1Q96K30 269 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR14A2Q96R54 314 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CKLFQ9UBR5 152 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UBE2QL1A1L167 161 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 G3V318 75 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CA11O75493 328 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MAS1P04201 325 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR5H8P0DN80 308 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MGMTP16455 207 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FUT3P21217 361 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYF6P23409 242 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CNTFRP26992 372 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ECI1P42126 302 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MMDQ15546 238 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AWAT2Q6E213 333 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDH26Q8IXH8 852 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR11H1Q8NG94 326 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GGHQ92820 318 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q96M66 194 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DERL3Q96Q80 235 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KLK15Q9H2R5 256 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GNB4Q9HAV0 340 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB9BQ9NP90 201 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 U3KQK5 164 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 I3L521 148 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATP6V0E1O15342 81 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BAG2O95816 211 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGLV1-40P01703 118 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GLAP06280 429 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ACTBP60709 375 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NABP2Q9BQ15 211 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR51J1Q9H342 316 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JPT1Q9UK76 154 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PDCD6O75340 191 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HLA-DRB1P01911 266 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CAPGP40121 348 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TAS2R43P59537 309 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GNB1P62873 340 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HTD2P86397 168 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RUNX1Q01196 453 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ST3GAL4Q11206 333 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MED21Q13503 144 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms