RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFA5Q01523 94 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 BTN1A1Q13410 526 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM219AQ8IW50 185 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ERGIC1Q969X5 290 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF488Q96MN9 340 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RAXQ9Y2V3 346 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 OOEPA6NGQ2 149 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 F8W036 122 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 J3KRW8 73 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 WRBO00258 174 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 HSPB6O14558 160 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CDIPTO14735 213 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 HSD17B6O14756 317 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAM20O43506 726 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TNFSF13O75888 250 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DFFBO76075 338 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPAN15O95858 294 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 GCH1P30793 250 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CFHR2P36980 270 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PEA15Q15121 130 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 IGFBP7Q16270 282 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZRG5 221 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 Q6ZS92 163 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SSX8Q7RTT4 187 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 STARD4Q96DR4 205 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 LURAP1Q96LR2 239 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 OR51B6Q9H340 312 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 HRH4Q9H3N8 390 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 WFDC1Q9HC57 220 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TREM1Q9NP99 234 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 COA4Q9NYJ1 87 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 KPTNQ9Y664 436 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1W2PR80 420 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SIRPB1O00241 398 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 MLNRO43193 412 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 LY86O95711 162 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 CECR9P0C854 216 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PAX6P26367 422 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMP3P35625 211 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 MPV17P39210 176 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 NBL1P41271 181 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PMS2P11Q13670 270 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 MIDNQ504T8 468 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 VWA1Q6PCB0 445 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 STX12Q86Y82 276 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 BATF2Q8N1L9 274 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 GALMQ96C23 342 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 TAAR6Q96RI8 345 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RAB9BQ9NP90 201 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 DKK4Q9UBT3 224 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms