RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DQB1P01920 261 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C1QBP02746 253 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CD1AP06126 327 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FSTP19883 344 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GZMHP20718 246 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CD24P25063 80 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CD34P28906 385 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR3A3P47888 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GNG10P50151 68 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DYNLT3P51808 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RAB25P57735 213 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BDH1Q02338 343 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HERPUD1Q15011 391 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MPV17LQ2QL34 196 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 Q5BKY6 102 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00596Q86U02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR9G1Q8NH87 305 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LEAP2Q969E1 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ARL11Q969Q4 196 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RPEQ96AT9 228 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KIRREL1Q96J84 757 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DERL3Q96Q80 235 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SOSTQ9BQB4 213 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BANF2Q9H503 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 V9GYH0 126 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087X0M5 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GX30 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 J3QR06 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PIN1P1O15428 100 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IL1AP01583 271 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV1-47P01700 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CSF1P09603 554 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SSTR5P35346 364 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 EFNB2P52799 333 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BLCAPP62952 87 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 INSL4Q14641 139 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RAB12Q6IQ22 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CDH26Q8IXH8 852 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UFD1Q92890 307 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM40LQ969M1 308 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM203Q969S6 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MMP28Q9H239 520 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2QL1A1L167 161 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00862A6NCI5 91 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OOSP1A8MZH6 123 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AIPO00170 330 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MPIG6BO95866 241 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND4P03905 459 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM106CPP0CH98 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CGB3P0DN86 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CGB7P0DN87 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MGMTP16455 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SRMP19623 302 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MYL9P24844 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MADCAM1Q13477 382 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HES1Q14469 280 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF79Q15937 498 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SSX1Q16384 188 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BAK1Q16611 211 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UTF1Q5T230 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SLC51BQ86UW2 128 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PRR18Q8N4B5 295 aa6.68□□□□□ -1.34
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