RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 CD3GP09693 182 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RAB6AP20340 208 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CD24P25063 80 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SDC2P34741 201 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ARFRP1Q13795 201 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HES1Q14469 280 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 IDNKQ5T6J7 187 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TMEM219Q86XT9 240 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 DTX3Q8N9I9 347 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PHF21AQ96BD5 680 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GALMQ96C23 342 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RAB3CQ96E17 227 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 AK3Q9UIJ7 227 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HSF4Q9ULV5 492 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TCF19Q9Y242 345 aa6.27□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HSD17B6O14756 317 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HSPA12AO43301 675 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TALDO1P37837 337 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RAB7AP51149 207 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 DYNLT3P51808 116 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 EFNB2P52799 333 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 RELBQ01201 579 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 UTF1Q5T230 341 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZSV7 163 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MOB3BQ86TA1 216 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LINC01006Q8NI28 216 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PTX4Q96A99 478 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CYYR1Q96J86 154 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CENPOQ9BU64 300 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ZNF747Q9BV97 191 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 JPT1Q9UK76 154 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.26□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 A6NDX4 124 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LDLRAD4O15165 306 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CHST1O43916 411 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SCGNO76038 276 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 NAPSAO96009 420 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 FAM106CPP0CH98 169 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GNB3P16520 340 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 REG1BP48304 166 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 TMEM50BP56557 158 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LOXL3P58215 753 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HLA-DRB3P79483 266 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HTD2P86397 168 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PLA2G7Q13093 441 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GNMTQ14749 295 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 ARL6IP1Q15041 203 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 HMGN3Q15651 99 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 Q3ZCU0 254 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 MORN2Q502X0 79 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR8H3Q8N146 312 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LYG1Q8N1E2 194 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 GAPTQ8N292 157 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LINC00311Q8N616 119 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 OR56B4Q8NH76 319 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PIFOQ8TCI5 191 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 YIPF6Q96EC8 236 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.25□□□□□ -1.41
SMG6-211ENST00000572369 C16orf95Q9H693 158 aa6.25□□□□□ -1.41
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