RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	OR2H2	O95918	312 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	HBG1	P69891	147 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	HBG2	P69892	147 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TGFBR3	Q03167	851 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ESPL1	Q14674	2120 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ICAM4	Q14773	271 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IL17B	Q9UHF5	180 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MED13	Q9UHV7	2174 aa		15.61	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D1B	O14796	132 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-14	P01704	120 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CD59	P13987	128 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF146	Q15072	292 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TGIF1	Q15583	401 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF429	Q86V71	674 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ARGFX	A6NJG6	315 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SIRPB1	O00241	398 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	OR8U8	P0C7N1	319 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PGA5	P0DJD9	388 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2K	P61086	200 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1CB	P62140	327 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	GABRA6	Q16445	453 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	RAB39B	Q96DA2	213 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LOXL4	Q96JB6	756 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CDH20	Q9HBT6	801 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf65	A6NEN9	183 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559		H3BP45	60 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	NXPH2	O95156	264 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-39	P01597	117 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-39	P04432	117 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZRM9	215 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TVP23C	Q96ET8	276 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		15.59	■□□□□ 0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SMPD2	O60906	423 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV2-5	P01817	119 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RAC2	P15153	192 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SELE	P16581	610 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PRR18	Q8N4B5	295 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MUCL1	Q96DR8	90 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	YPEL4	Q96NS1	127 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	MED12L	Q86YW9	2145 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PR80	420 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM210	A6NLX4	147 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CTAG1A	P78358	180 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SERF2	P84101	59 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	WDR86	Q86TI4	376 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		15.58	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF15	O95150	251 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-5	P01602	117 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK2	P20155	84 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM6	P40199	344 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CEBPG	P53567	150 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		15.57	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559		B4DEV8	164 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	AP4M1	O00189	453 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	WDR1	O75083	606 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	OR2B8P	P59922	312 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ARG2	P78540	354 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	DLK1	P80370	383 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF585B	Q52M93	769 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF766	Q5HY98	468 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CDIPT	O14735	213 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SP9	P0CG40	484 aa		15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF525	Q8N782	197 aa		15.56	■□□□□ 0.08

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