RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556272.1

PCNX1-211, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 2

Gene PCNX1, Length 2,942 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-211ENST00000556272 CCNOP22674 350 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 GABRR1P24046 479 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 LMO1P25800 156 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 PIGPP57054 158 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SPCS3P61009 180 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 LCN10Q6JVE6 187 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 Q6ZRG5 221 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM45BQ96B21 275 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SPIN2AQ99865 258 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 A0A0J9YW62 118 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 NRASP01111 189 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CCL3P10147 92 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SNCAP37840 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 RAB5BP61020 215 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 GPR173Q9NS66 373 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.29□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 C5orf63A6NC05 138 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TCN2P20062 427 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 KLK2P20151 261 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ACKR3P25106 362 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 RHEBQ15382 184 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR2A2Q6IF42 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR5T1Q8NG75 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 UMAD1C9J7I0 102 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 MSTNO14793 375 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 SIGLEC5O15389 551 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TSPAN15O95858 294 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 WNT2P09544 360 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ITGA3P26006 1051 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CEACAM3P40198 252 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 AKR1C2P52895 323 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CLDN15P56746 228 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 AKR1C1Q04828 323 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF266Q14584 549 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 LINC00596Q86U02 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM156Q8N614 296 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 IL22RA2Q969J5 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 USP34Q70CQ2 3546 aa6.28□□□□□ -1.4
PCNX1-211ENST00000556272 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 COLCA2A8K830 154 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 TOX4O94842 621 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 MT-ND4LP03901 98 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 S100A8P05109 93 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 OR5AC1P0C628 307 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 RNF224P0DH78 156 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 FUT3P21217 361 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 MAS1LP35410 378 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 FOLR3P41439 243 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 PAX5Q02548 391 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 GNMTQ14749 295 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 CR1LQ2VPA4 569 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 STPG3Q8N7X2 389 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 MALSU1Q96EH3 234 aa6.27□□□□□ -1.41
PCNX1-211ENST00000556272 ADGRG7Q96K78 797 aa6.27□□□□□ -1.41
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