RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SORL1Q92673 2214 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 DNAH7Q8WXX0 4024 aa13.2□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 ATP6V0E1O15342 81 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 LANCL1O43813 399 aa13.19□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 LIMS4P0CW20 117 aa13.19□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.18□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 GP9P14770 177 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 TENM2Q9NT68 2774 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa13.16□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 CKLFQ9UBR5 152 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 ERGIC3Q9Y282 383 aa13.16□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 GNMTQ14749 295 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 ECSCRQ19T08 205 aa13.15□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 GAPTQ8N292 157 aa13.15□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-214ENST00000548849 APH1BQ8WW43 257 aa13.15□□□□□ -0.3
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CS-214ENST00000548849 H3BNX3 289 aa13.14□□□□□ -0.31
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CS-214ENST00000548849 CHRNA7P36544 502 aa13.14□□□□□ -0.31
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CS-214ENST00000548849 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
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CS-214ENST00000548849 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-214ENST00000548849 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-214ENST00000548849 GHSRQ92847 366 aa13.14□□□□□ -0.31
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