RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOCS1O15524 211 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNL1O43396 289 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LY6G6FQ5SQ64 297 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HES5Q5TA89 166 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPRA1Q86W33 373 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRR18Q8N4B5 295 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR1L1Q8NH94 360 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC25A33Q9BSK2 321 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNG12Q9UBI6 72 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB22AQ9UL26 194 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SSR3Q9UNL2 185 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PPE3 182 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0QZK8 103 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFAIP8O95379 198 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM106CPP0CH98 169 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB6AP20340 208 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NR2C2APQ86WQ0 139 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR56B4Q8NH76 319 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTX4Q96A99 478 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GALMQ96C23 342 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C12orf4Q9NQ89 552 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR2S2Q9NQN1 319 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERTAD4Q9NUC0 356 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MGAT4AQ9UM21 535 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YPEL1O60688 119 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LPLP06858 475 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD24P25063 80 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VEGFCP49767 419 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM50BP56557 158 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HERPUD1Q15011 391 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEDD8Q15843 81 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MORN2Q502X0 79 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZPA2 131 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZTK2 550 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YPEL2Q96QA6 119 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PECRQ9BY49 303 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AK3Q9UIJ7 227 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOTOA8MTQ0 251 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0QZ24 198 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC31A2O15432 143 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGS11O94810 467 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF134P52741 427 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EBI3Q14213 229 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBLN7Q53RD9 439 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DRAM1Q8N682 238 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLHDC1Q8N7A1 406 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR51E2Q9H255 320 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOB4Q9Y3A3 225 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A087WXM4 84 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD36P16671 472 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BLCAPP62952 87 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNMTQ14749 295 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR52L2PQ8NGH6 319 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCTD7Q96MP8 289 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VWFP04275 2813 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB27BO00194 218 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FGF16O43320 207 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LANCL1O43813 399 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMY1AP04745 511 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AMY2AP04746 511 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GADD45AP24522 165 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD1BP29016 333 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HLA-DRB3P79483 266 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLA2G7Q13093 441 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB3CQ96E17 227 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 METTL21EPA6NDL7 271 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms