RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530036.1

RPUSD4-204, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, human

TSL 3

Gene RPUSD4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD4-204	ENST00000530036	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036		Q9N2K0	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPUSD4-204	ENST00000530036	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		J3QR06	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	XRCC3	O43542	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HPGDS	O60760	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DIRAS3	O95661	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	APOA1	P02647	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CD3G	P09693	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HTR1D	P28221	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IER3	P46695	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF137P	P52743	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LGALS4	P56470	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HTD2	P86397	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF45	Q02386	682 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GNMT	Q14749	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MMP28	Q9H239	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TOR1A	O14656	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC31A2	O15432	143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SSX5	O60225	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	YPEL1	O60688	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ELK1	P19419	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DTYMK	P23919	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PAX6	P26367	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CEACAM3	P40198	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GNG10	P50151	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DYNLT3	P51808	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRRX1	P54821	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PITPNA	Q00169	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BAMBI	Q13145	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IL18	Q14116	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms