RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 VEGFCP49767 419 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 UBE2E1P51965 193 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 APOC4P55056 127 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SNAP25P60880 206 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RAB2AP61019 212 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RANP62826 216 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HIST1H3AP68431 136 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 H3F3AP84243 136 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TPBGQ13641 420 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GUSBP1Q15486 140 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RNF165Q6ZSG1 346 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RFLNAQ6ZTI6 216 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HIST2H3AQ71DI3 136 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GALNT10Q86SR1 603 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FUNDC1Q8IVP5 155 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP82Q8N141 532 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC52Q8N7C0 313 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR52E4Q8NGH9 312 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR11L1Q8NGX0 322 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GRPEL2Q8TAA5 225 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GTSF1Q8WW33 167 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM104AQ969W3 186 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM19Q96E16 107 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 WDR34Q96EX3 536 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR10C1Q96KK4 312 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 UBE2E2Q96LR5 201 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF75AQ96N20 296 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 COMMD9Q9P000 198 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PAK5Q9P286 719 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 CD84Q9UIB8 345 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MYH6P13533 1939 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GPR179Q6PRD1 2367 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ASPMQ8IZT6 3477 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 CACNA1GO43497 2377 aa1.64□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 A0A087WWV3 80 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR6C6A6NF89 314 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ARL5CA6NH57 179 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PSPHP1O15172 72 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PFDN6O15212 129 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PLIN3O60664 434 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MED6O75586 246 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 P0C879 139 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GGT1P19440 569 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ALOX5APP20292 161 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 CXCR1P25024 350 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PAX6P26367 422 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 G0S2P27469 103 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 CCR7P32248 378 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PHBP35232 272 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SULT1A1P50225 295 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SULT1A2P50226 295 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RAB7AP51149 207 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RND2P52198 227 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 WNT4P56705 351 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TCTAP57738 103 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 LYZP61626 148 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR1Q1Q15612 314 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C15orf32Q32M92 178 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SPIN4Q56A73 249 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MARC1Q5VT66 337 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SAXO2Q658L1 398 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 STEAP4Q687X5 459 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IFT20Q8IY31 132 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 COX18Q8N8Q8 333 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 STOML3Q8TAV4 291 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ARL6Q9H0F7 186 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RHOFQ9HBH0 211 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF226Q9NYT6 803 aa1.63□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
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PDE4D-218ENST00000509368 FASNP49327 2511 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PRORSD1PA6NEY8 169 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C21orf140B9A014 251 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GABRPO00591 440 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FGF16O43320 207 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM228BP0C875 321 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF883P0CG24 379 aa1.63□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FOLR2P14207 255 aa1.63□□□□□ -2.15
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