RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTCH2	Q04721	2471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4D	F5H284	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf65	H3BRN8	121 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABARAP	H6UMI1	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7N7A8	449 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNL4	K9M1U5	179 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CA11	O75493	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP23A	O75900	390 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPPP	O94811	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5A	P00167	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD74	P04233	296 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGR3A	P08637	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT2	P09544	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCT	P09683	121 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF44	P15621	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIF	P27352	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS3	P35030	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABRA2	P47869	451 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLX6	P56179	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTG1	P62324	171 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	AES	Q08117	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MZT1	Q08AG7	82 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MICB	Q29980	383 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHE	Q5VZ18	495 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOGA1	Q86XE5	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8IYB0	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N402	240 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100Z	Q8WXG8	99 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A13	Q99584	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL19	Q99731	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9N2K0	584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIABLO	Q9NR28	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF25	Q9UIL4	384 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSCAM	O60469	2012 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERPINE3	A8MV23	424 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DVL1	O14640	695 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2D1B	O14796	132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM20	O43506	726 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FSTL3	O95633	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD3D	P04234	171 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLA	P06280	429 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTT2	P0CG29	244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTT2B	P0CG30	244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYL1	P12980	280 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DMA	P28067	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSTR2	P30874	369 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLX1	P56177	255 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX5	Q02548	391 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAX2	Q02962	417 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF273	Q14593	569 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HFE	Q30201	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00596	Q86U02	117 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8H2	Q8N162	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1L1	Q8NH94	360 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC107	Q8WV48	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BORCS5	Q969J3	196 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PERP	Q96FX8	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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