RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 TRAT1Q6PIZ9 186 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 TAF9BQ9HBM6 251 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 GNG12Q9UBI6 72 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 GHRLQ9UBU3 117 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 IL3RAP26951 378 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 THBS3P49746 956 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP10-11P60412 298 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 GPR50Q13585 617 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 IRF3Q14653 427 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MORN2Q502X0 79 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf100Q5SVJ3 147 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 STEAP3Q658P3 488 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 OR10K2Q6IF99 312 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 ODF3L1Q8IXM7 274 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 PRR18Q8N4B5 295 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MND1Q9BWT6 205 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 H0YHG0 523 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MOSP00540 346 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 VSIG8P0DPA2 414 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 CHATP28329 748 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF554Q86TJ5 538 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MS4A15Q8N5U1 240 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 NRG4Q8WWG1 115 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 S1PR3Q99500 378 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 SULT4A1Q9BR01 284 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP57Q9NU63 452 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 K7EIL1 84 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 TXNL1O43396 289 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 F2RL1P55085 397 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 QRFPP83859 136 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 C8orf86Q6ZUL3 223 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 FOXRED2Q8IWF2 684 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 PHYHIPQ92561 330 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 KCNK15Q9H427 330 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 RAB9BQ9NP90 201 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 PTGES3LE9PB15 166 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 LANCL1O43813 399 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 MPIG6BO95866 241 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 CFHR3Q02985 330 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 UNC119Q13432 240 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 SPHARQ15513 63 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 COMMD1Q8N668 190 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 OR52L2PQ8NGH6 319 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 P2RX4Q99571 388 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 HSPB9Q9BQS6 159 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 TMED9Q9BVK6 235 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 CST11Q9H112 138 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 OR2S2Q9NQN1 319 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 AP4M1O00189 453 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 UBBP0CG47 229 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 LSAMPQ13449 338 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 RNF152Q8N8N0 203 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 UCHL1P09936 223 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 HTR2CP28335 458 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A1P30531 599 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 AQP4P55087 323 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35B1P78383 322 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 HTD2P86397 168 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 LY6G6FQ5SQ64 297 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 GFI1Q99684 422 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 NICN1Q9BSH3 213 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 TM2D1Q9BX74 207 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 VCXQ9H320 206 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 JPT1Q9UK76 154 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM14DPA8MWL7 114 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A1O15245 554 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 SRMP19623 302 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 HMGN3Q15651 99 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 NKAPLQ5M9Q1 402 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf201Q7Z4U5 140 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 OR51D1Q8NGF3 324 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 DUSP21Q9H596 190 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0A6YYD4 124 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 GLT8D1Q68CQ7 371 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF880Q6PDB4 577 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM91Q6ZNR0 172 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 LCNL1Q6ZST4 164 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 CEACAM19Q7Z692 300 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 FAAP24Q9BTP7 215 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 YPEL1O60688 119 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 NAPSAO96009 420 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 MYCNOSP40205 109 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 MED22Q15528 200 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB3-211ENST00000490677 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms