RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	PID1	Q7Z2X4	250 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC00523	Q86TU6	105 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC00471	Q8N535	108 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC45	Q96CN5	670 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ACBD6	Q9BR61	282 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576		Q9BRP9	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	MED18	Q9BUE0	208 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CHST5	Q9GZS9	411 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	RGCC	Q9H4X1	137 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DMAC2	Q9NW81	257 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	GLS2	Q9UI32	602 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PTPRJ	Q12913	1337 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576		A0A1W2PQD3	144 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	RAB19	A4D1S5	217 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LINC00862	A6NCI5	91 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	RFXANK	O14593	260 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	FGF16	O43320	207 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	GNRH2	O43555	120 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	KLRC4	O43908	158 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ORC5	O43913	435 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PDCD6	O75340	191 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LY6H	O94772	140 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SOX14	O95416	240 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PSMG1	O95456	288 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SNAP29	O95721	258 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	NPPA	P01160	153 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	BPGM	P07738	259 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TPM2	P07951	284 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	UBB	P0CG47	229 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	STAG3L2	P0CL84	134 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ESD	P10768	282 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CD79B	P40259	229 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PEX19	P40855	299 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	P2RY2	P41231	377 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CCR2	P41597	374 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SERPINB10	P48595	397 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DAOA	P59103	153 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TSPAN5	P62079	268 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	HOXC5	Q00444	222 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	BEX3	Q00994	111 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SPAG1	Q07617	926 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CENPW	Q5EE01	88 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	C6orf183	Q5T699	404 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	HES3	Q5TGS1	186 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM42	Q69YG0	159 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	AMTN	Q6UX39	209 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	DRAM2	Q6UX65	266 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	LFNG	Q8NES3	379 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM107B-222	ENST00000488576	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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