RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 LEUTXA8MZ59 168 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TIMM23O14925 209 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 AIREO43918 545 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TSPAN9O75954 239 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 AMY1AP04745 511 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 AMY2AP04746 511 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TFAP2AP05549 437 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 GNB3P16520 340 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 NCS1P62166 190 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 FOXL1Q12952 345 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HERPUD1Q15011 391 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 LINC00311Q8N616 119 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR4F5Q8NH21 305 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 PTX4Q96A99 478 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF747Q9BV97 191 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 C16orf95Q9H693 158 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF702PQ9H963 129 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 Q9N2K0 584 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 JPT1Q9UK76 154 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RAB22AQ9UL26 194 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OOSP1A8MZH6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 H3BUI4 141 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TOR1AO14656 332 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HSD17B6O14756 317 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SPINT2O43291 252 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 FCGR3AP08637 254 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SCTP09683 121 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 REG1BP48304 166 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ALDH3B2P48448 385 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 PRRX1P54821 245 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HLA-DRB3P79483 266 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HTD2P86397 168 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 MADCAM1Q13477 382 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 CTF1Q16619 201 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 Q3ZCU0 254 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 MORN2Q502X0 79 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 Q6ZTK2 550 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 Q8N2B8 174 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 DRAM1Q8N682 238 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR56B4Q8NH76 319 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TOMM40LQ969M1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RAB3CQ96E17 227 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SSX5O60225 188 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 GABARAPO95166 117 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 CEACAM3P40198 252 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 VBP1P61758 197 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 IDNKQ5T6J7 187 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SETD6Q8TBK2 473 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RPEQ96AT9 228 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 GNG12Q9UBI6 72 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-207ENST00000483538 ETV7Q9Y603 341 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms