RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1L1Q8NH94 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR148Q8TDV2 347 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM106AQ96A25 262 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ORAI1Q96D31 301 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5B12Q96R08 314 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 VSIG4Q9Y279 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LDLRAD4O15165 306 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINT2O43291 252 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A17O43808 307 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LANCL1O43813 399 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV1-40P01703 118 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 HBZP02008 142 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2F2P13984 249 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 BDKRB2P30411 391 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RASSF2P50749 326 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MMDQ15546 238 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GAPTQ8N292 157 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 STX19Q8N4C7 294 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CBR4Q8N4T8 237 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RITA1Q96K30 269 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 Q96MT0 163 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A13Q99584 98 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PARP11Q9NR21 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 KMT2AQ03164 3969 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BNX3 289 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V0E1O15342 81 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CIB2O75838 187 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CNTFRP26992 372 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTBP60709 375 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RIPK1Q13546 671 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GNMTQ14749 295 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf183Q5T699 404 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 STEAP3Q658P3 488 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB12Q6IQ22 244 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM65Q6PI78 240 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF429Q86V71 674 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR18Q8N4B5 295 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4K15Q8NH41 348 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 APH1BQ8WW43 257 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 DCUN1D4Q92564 292 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CYYR1Q96J86 154 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51J1Q9H342 316 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB9BQ9NP90 201 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ETAA1Q9NY74 926 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OVOL1O14753 267 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SAP30O75446 220 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5HO75947 161 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DRB1P01911 266 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SPNP16150 400 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ETV1P50549 477 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB9AP51151 201 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NDPQ00604 133 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC58Q4VC31 144 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MUL1Q969V5 352 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM19Q96E16 107 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.27□□□□□ -1.25
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