RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2S2Q9NQN1 319 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG12Q9UBI6 72 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 JPT1Q9UK76 154 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNK7Q9Y2U2 307 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SCGNO76038 276 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG10P50151 68 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB7AP51149 207 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MOGAT2Q3SYC2 334 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MORN2Q502X0 79 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA1AQ53H76 456 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR18Q8N4B5 295 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf56Q8N813 242 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF747Q9BV97 191 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FUNDC2Q9BWH2 189 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf4Q9NQ89 552 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ABRACLQ9P1F3 81 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINE3A8MV23 424 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MFNGO00587 321 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 YPEL1O60688 119 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZPA2 131 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZSV7 163 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8H3Q8N146 312 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TOMM40LQ969M1 308 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 YPEL2Q96QA6 119 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG5Q9H1Y0 275 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 Q9N2K0 584 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ETV7Q9Y603 341 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPE3 182 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS11O94810 467 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CD3GP09693 182 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IL3RAP26951 378 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 KIR2DS4P43632 304 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF134P52741 427 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF137PP52743 207 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CT45A1Q5HYN5 189 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IDNKQ5T6J7 187 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CT45A3Q8NHU0 189 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC01006Q8NI28 216 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 STAB1Q9NY15 2570 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST1O43916 411 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GNB3P16520 340 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS19P39019 145 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SETD6Q8TBK2 473 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 LGALS14Q8TCE9 139 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPI3 338 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGB1BP1O14713 200 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC31A2O15432 143 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TFAP2AP05549 437 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM106CPP0CH98 169 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ALDH3B2P48448 385 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LSM3P62310 102 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DRB3P79483 266 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RHBDL2Q9NX52 303 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA2Q9UM82 520 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF114Q9Y508 228 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0A6YYH2 397 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 A6NJ64 397 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TRDCB7Z8K6 153 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B6O14756 317 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMM23O14925 209 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNL1O43396 289 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LPLP06858 475 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TGFBR1P36897 503 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 GNMTQ14749 295 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CDNFQ49AH0 187 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf88Q6PI97 169 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms