RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF519Q8TB69 540 aa7.23□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.23□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZN92 141 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF738Q8NE65 137 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TPPP2P59282 170 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDX4Q13162 271 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DS3Q14952 304 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 EXT1Q16394 746 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.21□□□□□ -1.26
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