RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 HSF4Q9ULV5 492 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 C4orf51C9J302 202 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 KCNMB1Q16558 191 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.89□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.89□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 CGB1A6NKQ9 187 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 GABRA6Q16445 453 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 COL4A5P29400 1685 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 MUC15Q8N387 334 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SNURFLB1AK76 121 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 HPRT1P00492 218 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 ELOBQ15370 118 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 NGFRP08138 427 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PAFAH1B2P68402 229 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.85□□□□□ -0.03
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