RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYDINQ4G0P3 5121 aa10.19□□□□□ -0.78
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
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