RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MADCAM1Q13477 382 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DS1Q14954 304 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSX2Q16385 188 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR18Q8N4B5 295 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1L1Q8NH94 360 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMTM3Q96MX0 182 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUX5Q96PT3 197 aa12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCG5Q9H222 651 aa12.37□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM172BPA6NC97 362 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY6LH3BQJ8 138 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YPEL1O60688 119 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIRAS3O95661 229 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DTYMKP23919 212 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL3RAP26951 378 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTG1P63261 375 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DRB3P79483 266 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDNFQ49AH0 187 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HACD4Q5VWC8 232 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10X1Q8NGY0 326 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD6Q8TBK2 473 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP3S1Q92572 193 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YPEL2Q96QA6 119 aa12.36□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB18Q9NP72 206 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PITPNC1Q9UKF7 332 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRDCB7Z8K6 153 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BUX3 64 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYBA1P05813 215 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCGR3AP08637 254 aa12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARFRP1Q13795 201 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MORN2Q502X0 79 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZPA2 131 aa12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYYR1Q96J86 154 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF260Q3ZCT1 412 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UTF1Q5T230 341 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8H3Q8N146 312 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4A4PQ8NGN8 299 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOMM40LQ969M1 308 aa12.34□□□□□ -0.43
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.33□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNL1O43396 289 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB25P24278 435 aa12.33□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNG2P59768 71 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXL1Q12952 345 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MZT2AQ6P582 158 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAMD12Q8N8I0 201 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.33□□□□□ -0.44
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