RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK14Q16539 360 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSG3Q16557 428 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 HBMQ6B0K9 141 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 EBLN2Q6P2I7 272 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPICQ8N5J4 248 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 CIB1Q99828 191 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT4Q9H2B2 425 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C11orf49Q9H6J7 331 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FIS1Q9Y3D6 152 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALG5Q9Y673 324 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLCH2O75038 1416 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PPV4 95 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM235A6NFC5 223 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD11O00231 422 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFXANKO14593 260 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATF1P18846 271 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RANBP1P43487 201 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNASE1L1P49184 302 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPAG1Q07617 926 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDGFRLQ15198 375 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTL10Q5JWF8 245 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8B12Q8NGG6 310 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGR3Q8TD06 166 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDCA4Q9BXL8 241 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXO44Q9H4M3 255 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 DISP1Q96F81 1524 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF532Q9HCE3 1301 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFPL4AA6NLU0 287 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZW10O43264 779 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ESDP10768 282 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTSEP14091 401 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKR1C4P17516 323 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM162BQ5T6X4 162 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAHD1Q6P587 224 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5D18Q8NGL1 313 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4A15Q8NGL6 344 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2AE1Q8NHA4 323 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS27Q9BQR3 290 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX12Q9UMY4 172 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC41PQ6P2S7 1318 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV41A0A0B4J266 112 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRIFINA4D1Z8 144 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf87E5RJ46 101 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASC3O15234 703 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 SC5DO75845 299 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRHBPP24387 322 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTAG1AP78358 180 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAM1Q15629 374 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOP1MTQ969P6 601 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIEN1Q9BRT3 115 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 STK38LQ9Y2H1 464 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATAD5Q96QE3 1844 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYO15BQ96JP2 1530 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLX4Q8IY92 1834 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCRTO43612 131 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMPSTE24O75844 475 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK14O94921 469 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCR7P32248 378 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM258P61165 79 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 NNATQ16517 81 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSP90B2PQ58FF3 399 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 C6orf183Q5T699 404 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDCL2Q8N4E4 241 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52K2Q8NGK3 314 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5J2Q8NH18 312 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGLYRP3Q96LB9 341 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q96M85 177 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBX5Q99593 518 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED18Q9BUE0 208 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf4Q9NR00 106 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R13Q9NYV9 303 aa0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms