RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 GNG10P50151 68 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 VBP1P61758 197 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ARFRP1Q13795 201 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGN3Q15651 99 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR107Q5VW38 600 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF880Q6PDB4 577 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00311Q8N616 119 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 DTX3Q8N9I9 347 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 UBALD1Q8TB05 177 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OCSTAMPQ9BR26 566 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA2Q9UM82 520 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A075B6Q4 140 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0A6YYH2 397 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NJ64 397 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GABARAPO95166 117 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LPLP06858 475 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GNB3P16520 340 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL5P46777 297 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 NCS1P62166 190 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PITPNAQ00169 270 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 MOGAT2Q3SYC2 334 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM40LQ969M1 308 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 Q9N2K0 584 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 DIABLOQ9NR28 239 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SCOCQ9UIL1 159 aa12.43□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GUS0 222 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6LH3BQJ8 138 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 MFNGO00587 321 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 YPEL1O60688 119 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TGFBR1P36897 503 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DS4P43632 304 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB7AP51149 207 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RORCP51449 518 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DS1Q14954 304 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CDNFQ49AH0 187 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA1AQ53H76 456 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6G6FQ5SQ64 297 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4F5Q8NH21 305 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 YPEL2Q96QA6 119 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.42□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TRDCB7Z8K6 153 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HAX1O00165 279 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA7O95182 113 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DRB3P79483 266 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6EQ16553 131 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CTF1Q16619 201 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 MORN2Q502X0 79 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 UTF1Q5T230 341 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HACD4Q5VWC8 232 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OLFML2AQ68BL7 652 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8H3Q8N146 312 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52L2PQ8NGH6 319 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 AP3S1Q92572 193 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TCF19Q9Y242 345 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPE3 182 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA12AO43301 675 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 FCGR3AP08637 254 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM106CPP0CH98 169 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 DTYMKP23919 212 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB25P24278 435 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PAX6P26367 422 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB13P51153 203 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RAG2P55895 527 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4A4PQ8NGN8 299 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PIFOQ8TCI5 191 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 CYYR1Q96J86 154 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1E2Q96JD6 320 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL7BQ9BQE9 202 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCG5Q9H222 651 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 BEX1Q9HBH7 125 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 C1RLQ9NZP8 487 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.39□□□□□ -0.43
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