RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.66□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 FBN2P35556 2912 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 HSD17B6O14756 317 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 HEXAP06865 529 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 BCAP31P51572 246 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 GSX2Q9BZM3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTV1-201ENST00000367576 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 C22orf46C9J442 243 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 F2RL2O00254 374 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 IGHV2-5P01817 119 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OR8U9P0C7N5 309 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 RAG2P55895 527 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ESCO2Q56NI9 601 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OR8U1Q8NH10 309 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 TMEM230Q96A57 120 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OPN4Q9UHM6 478 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 VAMP1P23763 118 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 HTD2P86397 168 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R1AQ13522 171 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GPHA2Q96T91 129 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ZNF221Q9UK13 617 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 RNF150Q9ULK6 438 aa14.64□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PPE3 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 C7orf66A4D0T2 115 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OR4E1P0C645 316 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DNASE1P24855 282 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ECI1P42126 302 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LOXL3P58215 753 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GHITMQ9H3K2 345 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 JPT1Q9UK76 154 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.63□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ST8SIA5O15466 376 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PRAF2O60831 178 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PAX1P15863 534 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GNG10P50151 68 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OR51J1Q9H342 316 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 RAB9BQ9NP90 201 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PRR13Q9NZ81 148 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PSG11Q9UQ72 335 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SLC31A2O15432 143 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 TNFSF12O43508 249 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 IL5P05113 134 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GNRHRP30968 328 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 UCP3P55916 312 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DLX1P56177 255 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DLX6P56179 175 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 PIGPP57054 158 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LMO4P61968 165 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LCN2P80188 198 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 OR2D2Q9H210 308 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.62□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 VWC2LB2RUY7 222 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 NDUFS8O00217 210 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 GPR37O15354 613 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R31P59538 309 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 DHRS2Q13268 280 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 MORN2Q502X0 79 aa14.61□□□□□ -0.07
LTV1-201ENST00000367576 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms