RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00311Q8N616 119 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 OR56B4Q8NH76 319 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CFHR4Q92496 578 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 KCNIP1Q9NZI2 227 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 RAB22AQ9UL26 194 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 HSF4Q9ULV5 492 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 KCNK7Q9Y2U2 307 aa21.61■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 NOTOA8MTQ0 251 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 OOSP1A8MZH6 123 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 HSD17B6O14756 317 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 BRS3P32247 399 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 TGFBR1P36897 503 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 KIR2DS4P43632 304 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 MXD1Q05195 221 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZTK2 550 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 DRAM1Q8N682 238 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 OR56B1Q8NGI3 324 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 SETD6Q8TBK2 473 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 OR2S2Q9NQN1 319 aa21.6■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 MNDAP41218 407 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 BLCAPP62952 87 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF554Q86TJ5 538 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CAPSLQ8WWF8 208 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD7Q96MP8 289 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 CITED1Q99966 193 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 OCSTAMPQ9BR26 566 aa21.59■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 MORN2Q502X0 79 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 TPRA1Q86W33 373 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 YIPF6Q96EC8 236 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 RAB9BQ9NP90 201 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 JPT1Q9UK76 154 aa21.58■■□□□ 1.05
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RAB27BO00194 218 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RAB6AP20340 208 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGDIBP52566 201 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 Q3ZCU0 254 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf4Q9NQ89 552 aa21.57■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RAB7AP51149 207 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM95Q3KNT9 176 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 Q8N2B8 174 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 OR10R2Q8NGX6 335 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 OR2T6Q8NHC8 308 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 GALMQ96C23 342 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RAB3CQ96E17 227 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SERTAD4Q9NUC0 356 aa21.56■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 MFNGO00587 321 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM18P0DKX4 95 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 GNB3P16520 340 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 HTD2P86397 168 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 MOB1BQ7L9L4 216 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 OR8H3Q8N146 312 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 LGALS14Q8TCE9 139 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 IL1F10Q8WWZ1 152 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 Q9N2K0 584 aa21.55■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 OR2F2O95006 317 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 AMY1AP04745 511 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 AMY2AP04746 511 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RANBP1P43487 201 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-DRB3P79483 266 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC1Q8N7A1 406 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 A0A075B6Q4 140 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 YPEL1O60688 119 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 SCTP09683 121 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF137PP52743 207 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 MOB3BQ86TA1 216 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 YPEL2Q96QA6 119 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa21.53■■□□□ 1.04
TPGS1-201ENST00000359315 ATG5Q9H1Y0 275 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms