RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MMD2Q8IY49 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 SPSB4Q96A44 273 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 PARLQ9H300 379 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 C7orf71A4D174 169 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 Q6ZNB5 142 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 KIR2DL4Q99706 377 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 KLK13Q9UKR3 277 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 UBE2L6O14933 153 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 OTPQ5XKR4 325 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 PNKDQ8N490 385 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 OR4X1Q8NH49 305 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 SMIM8Q96KF7 97 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 J3QW42 95 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 ST20Q9HBF5 79 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 ARSAP15289 507 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 SP6Q3SY56 376 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 VHLLQ6RSH7 139 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM202A6NGA9 273 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 PRRG2O14669 202 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 CDKN3Q16667 212 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRB-202ENST00000334414 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 HERPUD1Q15011 391 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 C10orf111Q8N326 155 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF714Q96N38 554 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 EMC6Q9BV81 110 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-202ENST00000334414 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.83□□□□□ -1.64
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