RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM40LQ969M1 308 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 APH1AQ96BI3 265 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MOB3AQ96BX8 217 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10C1Q96KK4 312 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MICU1Q9BPX6 476 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC11CQ9BY50 192 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR13Q9H1Z4 485 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP11Q9NR21 331 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf63A6NC05 138 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5B21A6NL26 309 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MXE2 369 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YIZ8 118 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C2Y5 167 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ST8SIA3O43173 380 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPTL7O43827 346 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFS7O75251 213 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN9O75954 239 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CDS2O95674 445 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SCGB1D2O95969 90 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PLATP00750 562 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HKR1P10072 659 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP9P14780 707 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF708P17019 499 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SRD5A1P18405 259 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN1AP38936 164 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 P2RY1P47900 373 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CAV2P51636 162 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF12P61328 243 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF92Q03936 586 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SRYQ05066 204 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF573Q86YE8 665 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 LFNGQ8NES3 379 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK7Q8TDX7 302 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED6Q8WW62 240 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM8Q96KF7 97 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CALHM2Q9HA72 323 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GP6Q9HCN6 339 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTCH1P46531 2555 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR31O00270 319 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR1AO14656 332 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCD4O14678 606 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HS3ST1O14792 307 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA12AO43301 675 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 MED6O75586 246 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF13O75888 250 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN15O95858 294 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV4-39P01824 125 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC11BP0C7V7 166 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 EGR1P18146 543 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 LHX2P50458 406 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FXYD4P59646 89 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB2AP61019 212 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 VAMP2P63027 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG3P63215 75 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDX4Q13162 271 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PEA15Q15121 130 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGYQ3MUY2 71 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-201ENST00000264640 VWA1Q6PCB0 445 aa5.95□□□□□ -1.46
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