RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638603.1

SCARB2-211, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-211ENST00000638603 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.01□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CXCL1P09341 107 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ICAM4Q14773 271 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ADIRFQ15847 76 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 C1orf87Q8N0U7 546 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 NECAP1Q8NC96 275 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SMOC1Q9H4F8 434 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 TCFL5Q9UL49 500 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 UCP1P25874 307 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 UCP2P55851 309 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HBG1P69891 147 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HBG2P69892 147 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 COL19A1Q14993 1142 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HERPUD1Q15011 391 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 C3AR1Q16581 482 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 FAM58AQ8N1B3 248 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 FAM210BQ96KR6 192 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CABLES2Q9BTV7 478 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PRDM14Q9GZV8 571 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RNF150Q9ULK6 438 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 BDP1A6H8Y1 2624 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 LY86O95711 162 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 IGHV2-5P01817 119 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CYC1P08574 325 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 FABP4P15090 132 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 DEFA6Q01524 100 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ID3Q02535 119 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 Q6ZSR3 168 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF573Q86YE8 665 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RAB40CQ96S21 281 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RPRMQ9NS64 109 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 A0A1W2PR80 420 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PINLYPA6NC86 204 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 H0Y980 276 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SYNGR2O43760 224 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 IFNA1P01562 189 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CELA3AP09093 270 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF383Q8NA42 475 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 LHX4Q969G2 390 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HES7Q9BYE0 225 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CYTIPO60759 359 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 IGHEP01854 428 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ERVFRD-1P60508 538 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ELOBQ15370 118 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 KHDC3LQ587J8 217 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 NMSQ5H8A3 153 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 A0A0G2JRQ6 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 GNG3P63215 75 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CLN3Q13286 438 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PMS2CLQ68D20 193 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ABI3Q9P2A4 366 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 GAB2Q9UQC2 676 aa6.99□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 CLDN34H7C241 214 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 HOXA5P20719 270 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ADGRG7Q96K78 797 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 SVILO95425 2214 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 A0A1B0GU03 582 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 ARGFXA6NJG6 315 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 NXPH2O95156 264 aa6.98□□□□□ -1.29
SCARB2-211ENST00000638603 NAPSAO96009 420 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms