RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-215	ENST00000622972	MFNG	O00587	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PEX14	O75381	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	TSPAN15	O95858	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	CYB5A	P00167	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	CSN2	P05814	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PTHLH	P12272	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GABRR1	P24046	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	COX7A1	P24310	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SERPINB10	P48595	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	P2RX3	P56373	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PROK1	P58294	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GRK1	Q15835	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RAB11B	Q15907	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972		Q8IYB0	196 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972		Q8N1Y9	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	THRSP	Q92748	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SNX22	Q96L94	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ODAM	A1E959	279 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MAGEB3	O15480	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SSX5	O60225	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	TSPAN9	O75954	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	NAPSA	O96009	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	IL1A	P01583	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	CHRM2	P08172	466 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GTF2F2	P13984	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF44	P15621	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MYL9	P24844	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SSTR5	P35346	364 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	BMX	P51813	675 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	EDDM3B	P56851	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PAX5	Q02548	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PECR	Q9BY49	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINC00963-215	ENST00000622972	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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