RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NNC1 897 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR31O00270 319 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TUSC2O75896 110 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DTX2Q86UW9 622 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB108BQ8NET1 73 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf79Q96F83 325 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1E2Q96JD6 320 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SUCNR1Q9BXA5 334 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC5A7Q9GZV3 580 aa18.92■□□□□ 0.62
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CAPNS1-212ENST00000591041 FXYD6Q9H0Q3 95 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC79Q9P2D8 2635 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFB3O43676 98 aa18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-212ENST00000591041 HTD2P86397 168 aa18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD9Q7L273 389 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR18Q8N4B5 295 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CASTOR1Q8WTX7 329 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB39BQ96DA2 213 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 COQ2Q96H96 371 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-212ENST00000591041 GOSR2O14653 212 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GYPAP02724 150 aa18.9■□□□□ 0.62
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CAPNS1-212ENST00000591041 PIGPP57054 158 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RND3P61587 244 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FGL1Q08830 312 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 BAMBIQ13145 260 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SECTM1Q8WVN6 248 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL11Q969Q4 196 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 HYLS1Q96M11 299 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCE1Q9P212 2302 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF212BA8MTL3 300 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA21P01568 189 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GLIPR1P48060 266 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MSMO1Q15800 293 aa18.89■□□□□ 0.61
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CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.89■□□□□ 0.61
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB34Q8NCN2 500 aa18.89■□□□□ 0.61
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CAPNS1-212ENST00000591041 OR10V1Q8NGI7 309 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MRGPRDQ8TDS7 321 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB1CQ92928 201 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GAFA1Q96PS6 74 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL13Q99616 98 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA60Q9H7X0 242 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 KAAG1Q9UBP8 84 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MV72 311 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf77C9JDV5 145 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TMPRSS2O15393 492 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 HBZP02008 142 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-GP17693 338 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 C4BPBP20851 252 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CEACAM6P40199 344 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZPA2 131 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 NOXA1Q86UR1 476 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB18Q9NP72 206 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC2A9Q9NRM0 540 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 COMMD9Q9P000 198 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 METRNQ9UJH8 293 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 JPT1Q9UK76 154 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MAB21L2Q9Y586 359 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPEQ02224 2701 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DYSFO75923 2080 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR37O15354 613 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 HERPUD1Q15011 391 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf71Q6IPW1 123 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GALNT14Q96FL9 552 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CYYR1Q96J86 154 aa18.87■□□□□ 0.61
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