RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 S1PR3Q99500 378 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPE3 182 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 DEGS1O15121 323 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 TNFRSF6BO95407 300 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 IGF1P05019 195 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 CGB3P0DN86 165 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 CGB7P0DN87 165 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V1B2P21281 511 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 GK3PQ14409 553 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SPCS2Q15005 226 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 RFT1Q96AA3 541 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf35Q96D05 121 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC140Q96MF4 163 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OR4C12Q96R67 309 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 KLK15Q9H2R5 256 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 A8MZ25 164 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 OCM2P0CE71 109 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 ATF1P18846 271 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 HTR1FP30939 366 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SLURP1P55000 103 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SPATS1Q496A3 300 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 CADM3Q8N126 398 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N1Y9 231 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 SORL1Q92673 2214 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 LINC01619G3V211 115 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-12P01611 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OR8U9P0C7N5 309 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ARSBP15848 533 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF20P17024 532 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 IL3RAP26951 378 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 F2RL1P55085 397 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 PITPNAQ00169 270 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 HAGHQ16775 308 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-210ENST00000578916 OPALINQ96PE5 141 aa7.04□□□□□ -1.28
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