RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 TM2D1Q9BX74 207 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-205ENST00000560067 V9GY05 133 aa9.97□□□□□ -0.81
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C12orf77C9JDV5 145 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 GALP22466 123 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHATP28329 748 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 QRFPP83859 136 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 UNC119Q13432 240 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 MADCAM1Q13477 382 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C11orf88Q6PI97 169 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF773Q6PK81 442 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAPTQ8N292 157 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRR18Q8N4B5 295 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNK15Q9H427 330 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.96□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1W2PPE3 182 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CD24P25063 80 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLDN12P56749 244 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CITED1Q99966 193 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 NICN1Q9BSH3 213 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNG12Q9UBI6 72 aa9.95□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 TIMM23O14925 209 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 HBZP02008 142 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM106CPP0CH98 169 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB7AP51149 207 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 EFNB2P52799 333 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 LOXL3P58215 753 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRTAP10-3P60369 221 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q3ZCU0 254 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRR31Q5SQ13 230 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 HES5Q5TA89 166 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C22orf42Q6IC83 251 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR1L1Q8NH94 360 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.94□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB3BP20337 219 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL3RAP26951 378 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10A3P58181 314 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZTK2 550 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR8H3Q8N146 312 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q8N2B8 174 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC00311Q8N616 119 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYYR1Q96J86 154 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF702PQ9H963 129 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB22AQ9UL26 194 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 STUB1Q9UNE7 303 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SSR3Q9UNL2 185 aa9.93□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A0A6YYD4 124 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHISA3A0PJX4 238 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFITM5A6NNB3 132 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0QZ24 198 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSD17B6O14756 317 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 SOCS1O15524 211 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 PEX14O75381 377 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR2F2O95006 317 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 LPLP06858 475 aa9.92□□□□□ -0.82
USP3-AS1-205ENST00000560067 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms