RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	AWAT2	Q6E213	333 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZSR3	168 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM46B	Q96A09	425 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A28	Q96A46	364 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SDSL	Q96GA7	329 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TSC22D3	Q99576	134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MGLL	Q99685	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0G2JK05	382 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM172BP	A6NC97	362 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TOR1A	O14656	332 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NPFF	O15130	113 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ARG1	P05089	322 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF728	P0DKX0	622 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PSG1	P11464	419 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2F2	P13984	249 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OMG	P23515	440 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	MPZ	P25189	248 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PAX6	P26367	422 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GLIPR1	P48060	266 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	BMX	P51813	675 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVK11-1	P61568	191 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PAX2	Q02962	417 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR50	Q13585	617 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR176	Q14439	515 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	IRF3	Q14653	427 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RY14	Q15391	338 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAM1	Q15629	374 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TWIST1	Q15672	202 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	NEDD8	Q15843	81 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	LY6E	Q16553	131 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF9	Q16594	264 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	HES5	Q5TA89	166 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT74	Q7RTS7	529 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR8H2	Q8N162	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	DERL3	Q96Q80	235 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-238	ENST00000556288	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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