RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TOMM40LQ969M1 308 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 RPEQ96AT9 228 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 NICN1Q9BSH3 213 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OOSP1A8MZH6 123 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TIMM23O14925 209 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TSPAN15O95858 294 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 AMY1AP04745 511 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 AMY2AP04746 511 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 GLAP06280 429 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 BRS3P32247 399 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 GABARAPL2P60520 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 MADCAM1Q13477 382 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 HERPUD1Q15011 391 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 C11orf88Q6PI97 169 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CFHR4Q92496 578 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TM2D1Q9BX74 207 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SHISA3A0PJX4 238 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 M0QZ24 198 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SLC17A2O00624 439 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SLC31A2O15432 143 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 BPNT1O95861 308 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 HBZP02008 142 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 Q6ZPA2 131 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 DRAM1Q8N682 238 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OR56B4Q8NH76 319 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CA11O75493 328 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 ARL6IP5O75915 188 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OR2F2O95006 317 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 LINC00311Q8N616 119 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 ZNF439Q8NDP4 499 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OR10X1Q8NGY0 326 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 MNDAP41218 407 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 ARHGDIBP52566 201 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CLDN12P56749 244 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 C6orf183Q5T699 404 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 PRR18Q8N4B5 295 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-222ENST00000550996 HSD17B6O14756 317 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 SPINT2O43291 252 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 REG1BP48304 166 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 ZNF134P52741 427 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 PLA2G7Q13093 441 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 GNMTQ14749 295 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 RAB11BQ15907 218 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 Q6ZTK2 550 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 SPARTQ8N0X7 666 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 SOCS1O15524 211 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 CD28P10747 220 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 ARSBP15848 533 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 RAB7AP51149 207 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 OR10A3P58181 314 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 CT45A1Q5HYN5 189 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 OR8H3Q8N146 312 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 DTX3Q8N9I9 347 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-222ENST00000550996 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms