RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549302.1

ARL1-206, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 1, human

TSL 3

Gene ARL1, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL1-206	ENST00000549302	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	NRBF2	Q96F24	287 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	NSL1	Q96IY1	281 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR5B12	Q96R08	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	TXNL1	O43396	289 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	IFNA6	P05013	189 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	IGF1	P05019	195 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	SSTR5	P35346	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	RUNX1	Q01196	453 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	TP53I3	Q53FA7	332 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	DCUN1D4	Q92564	292 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	RFK	Q969G6	155 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	EME1	Q96AY2	570 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR4C12	Q96R67	309 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	MBOAT4	Q96T53	435 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	OR51J1	Q9H342	316 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	RAB9B	Q9NP90	201 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ARL1-206	ENST00000549302		I3L521	148 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	FKBP6	O75344	327 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ISG15	P05161	165 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	HTR1A	P08908	422 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	KIR3DL2	P43630	455 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	DAP	P51397	102 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	CFHR3	Q02985	330 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	IL13RA2	Q14627	380 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RSU1	Q15404	277 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MMD	Q15546	238 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	KISS1	Q15726	138 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	FAHD1	Q6P587	224 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302		Q8N6K4	173 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ARL11	Q969Q4	196 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	GPER1	Q99527	375 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	THTPA	Q9BU02	230 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	GNB4	Q9HAV0	340 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF580	Q9UK33	172 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ZAR1L	A6NP61	321 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	LINC01619	G3V211	115 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	CALB2	P22676	271 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	MYF6	P23409	242 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	VEGFC	P49767	419 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	RAB9A	P51151	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	GNB1	P62873	340 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	EFNB1	P98172	346 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	PITPNA	Q00169	270 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	TMED1	Q13445	227 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	FLOT2	Q14254	428 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	GALE	Q14376	348 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF691	Q5VV52	312 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	C12orf73	Q69YU5	71 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	ELP2	Q6IA86	826 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	SATL1	Q86VE3	508 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	STX19	Q8N4C7	294 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	LINC00311	Q8N616	119 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ARL1-206	ENST00000549302	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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